Die Saison 2006/07 ist auch in der zweiten Liga als Saison der großen Umbrüche bekannt. Aufsteiger wurden der Karlsruher SC, Carl Zeiss Jena sowie Eintracht Braunschweig, während der SC Freiburg, der SC Paderborn 07, Wacker Burghausen und die Spvgg Unterhaching den Gang in die Regionalliga antreten mussten.
Die Saison 2006/07 ist auch in der zweiten Liga als Saison der großen Umbrüche bekannt. Aufsteiger wurden der Karlsruher SC, Carl Zeiss Jena sowie Eintracht Braunschweig, während der SC Freiburg, der SC Paderborn 07, Wacker Burghausen und die Spvgg Unterhaching den Gang in die Regionalliga antreten mussten.