Metroid que tiene la capacidad de separarse por fisión. El Metroid Fisión es un mutante que puede dividirse en dos. Esta división crea dos nuevas criaturas con invulnerabilidad a la mayoría de las armas. Este efecto es inestable, lo que puede provocar la debilidad a un tipo de arma. Esta debilidad parece ser aleatoria debido a la naturaleza caótica de la mutación por Phazon.
Especie: Pirata Omega. Es el más poderoso de las Fuerzas de Piratas Élite.
:''El Pirata Omega puede hacerse invisible, aunque al hacerlo se vuelve vulnerable ya que absorbe toda la energía de sus sistemas de defensa. Su exposición al Phazon le ayuda a regenerar tejidos y órganos dañados. Considerado como el pináculo del programa de Piratas Élite, este enemigo debe ser tratado con extrema prudencia y el máximo de potencia de fuego.