De Libertaanse Supercup 2016 werd georganiseerd op zaterdag 6 augustus 2016 in het Nationaal Stadion in Wikistad, Libertas. De winnaars van de Eerste Divisie en de Beker van Libertas strijden tegen elkaar in het supercupduel. Dit waren respectievelijk FC Olympia, dat de vorige editie verloor, en FC Skeend. De wedstrijd werd gewonnen door FC Skeend met 2-0.