Forma de vida altamente evolucionada que produce Phazon.
''La aberración conocida como Metroid Prime es el origen del Phazon, lo que la hace muy poderosa. Una anomalía genética la hace propensa a ciertas armas durante cortos períodos de tiempo. Su cabeza es su único punto débil real; los ataques a otras partes de su cuerpo son inútiles. En lo ofensivo, el Metroid Prime está provisto de diversas armas biológicas y mecánicas. Entre ellas podemos destacar el Aliento Ultracongelante, los Multimisiles, los Rayos Paralizantes y los Emisores de Partículas. Su desmedida fuerza y su carapacho de púas lo hacen letal en el combate cuerpo a cuerpo. Se recomienda el uso de la fuerza máxima al enfrentarse a este enemigo.