De Molendijk is ontstaan bij de inpoldering van Nieuw Bonaventura eind 16e eeuw. Aan de Molendijk bevindt zich de molen Het Vliegend Hert. Het beginpunt van de Molendijk bevindt zich in de westhoek van het Dokter Van der Bijlplein, in dezelfde hoek waar ook de Noord-Voorstraat en de Leerambachtstraat beginnen. Het eindpunt (of, vanuit Puttershoeks oogpunt gezien: het beginpunt) van de dijk bevindt zich in Puttershoek aan het Schouteneinde. Ook in Puttershoek bevindt zich een molen langs de dijk, genaamd De Lelie.