El Kunai Dios Trueno Volador (飛雷神クナイ, Hiraishin Kunai) son kunais especiales utilizados por Minato Namikaze, para usar principalmente su Jutsu del Dios Trueno Volador. A diferencia de los Kunais normales, este tiene tres hojas en vez de una y en el mango (que es más gruesa de lo normal) se encuentra el "marcador", es decir, el sello que le permite a Minato teletransportarse, Minato también dijo que es un poco más pesado que un kunai normal. Las puntas de ellos también hace más letal en la lucha cuerpo a cuerpo. Parecía que prefieren utilizar estos kunai especial sobre el tipo estándar.